Bandera de Loja, se divide en cinco franjas horizontales: roja, azul, amarilla, azul y roja.
La bandera de la ciudad de Loja, fue adoptada por el Muy Ilustre Concejo Cantonal de Loja el 16 de octubre de 1963.
La bandera de la ciudad de Loja, como homenaje de admiración a la Madre Patria, a su fundador el capitán Don Alonso de Mercadillo y a los símbolos ecuatorianos, adopta los colores rojo, azul y amarillo que ostenta el escudo de la Muy Noble y Muy Leal Ciudad de Loja, concedida por el Rey de España Felipe II en el año de 1571, cuyos colores serán distribuidos y alternados en cinco franjas horizontales.